مکانیسم PTGS :
کشفیات چندسال اخیر باعث شفاف تر شدن مکانیسم RNAi شده است.باتوجه به نتایج این تحقیقات که از آزمایش هایی برروی موجودات زنده و در محیط Invitro بدست آمده است در مدل های ارائه شده برای PTGS دو مرحله وجود دارد:
در مرحله آغاز یک ترکیب نوکلئازی(Dicer) به dsRNA های بزرگ متصل می شود و آنها را به قطعات ۲۱ تا ۲۵ نوکلوتیدی siRNA (small interfering RNA)مجزا برش می دهد. در مرحله دوم این siRNA ها به کمپلکس آنزیمی RISC اتصال پیدا می کنند و باعث تخریب mRNAهای تک رشته ای همولوگ با خود می شوند.(تصاویر٤،٥،٦)
۷-۱-۲-۲ : تبدیل dsRNA به siRNA :